Inkscapeで下絵の上にレイヤー毎にパーツを置いていって表示、非表示を切り替えてPNGを作ってアニメにしています。
MACで下絵を利用してその上にドロー系で描いてアニメにできるようないいツールないかなあ〜。
もちろんオープンソースで(笑)